Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tgm1Q9JLF6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Tgm1Q9JLF6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Tgm1Q9JLF6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tgm1Q9JLF6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms