Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Tmod2Q9JKK7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Tmod2Q9JKK7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Tmod2Q9JKK7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Tmod2Q9JKK7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
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Tmod2Q9JKK7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Tmod2Q9JKK7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Tmod2Q9JKK7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Tmod2Q9JKK7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Tmod2Q9JKK7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Tmod2Q9JKK7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Tmod2Q9JKK7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Tmod2Q9JKK7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tmod2Q9JKK7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmod2Q9JKK7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tmod2Q9JKK7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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