Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx6Q9JKK1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms