Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nectin1Q9JKF6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nectin1Q9JKF6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms