Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ybx3Q9JKB3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ybx3Q9JKB3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ybx3Q9JKB3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms