Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uchl3Q9JKB1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Uchl3Q9JKB1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms