Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smpd3Q9JJY3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smpd3Q9JJY3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms