Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Alyref2Q9JJW6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Alyref2Q9JJW6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms