Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gfra4Q9JJT2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gfra4Q9JJT2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms