Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Akip1Q9JJR5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Akip1Q9JJR5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms