Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnbip1Q9JJN6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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