Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc86Q9JJ89 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc86Q9JJ89 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms