Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ercc6l2Q9JIM3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ercc6l2Q9JIM3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ercc6l2Q9JIM3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms