Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcirg1Q9JHF5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcirg1Q9JHF5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms