Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rb1cc1Q9ESK9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rb1cc1Q9ESK9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms