Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESE1

Lrba, Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LrbaQ9ESE1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LrbaQ9ESE1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LrbaQ9ESE1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms