Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Chrnb2Q9ERK7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Chrnb2Q9ERK7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms