Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlnrd1Q9ERE8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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