Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tfip11Q9ERA6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tfip11Q9ERA6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tfip11Q9ERA6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms