Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PpbpQ9EQI5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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