Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms