Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfgap1Q9EPJ9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfgap1Q9EPJ9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms