Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rnft1Q9DCN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnft1Q9DCN7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms