Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CrotQ9DC50 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CrotQ9DC50 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms