Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cbx6Q9DBY5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cbx6Q9DBY5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms