Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Swt1Q9DBQ9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Swt1Q9DBQ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms