Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ftsj3Q9DBE9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ftsj3Q9DBE9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms