Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smg9Q9DB90 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Smg9Q9DB90 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms