Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop5Q9DB28 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pop5Q9DB28 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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Pop5Q9DB28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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Pop5Q9DB28 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop5Q9DB28 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms