Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnpy3Q9DAU1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnpy3Q9DAU1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnpy3Q9DAU1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms