Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc54Q9DAL3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc54Q9DAL3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms