Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem239Q9DA47 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem239Q9DA47 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms