Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph9Q9D9V4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph9Q9D9V4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms