Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Efhc1Q9D9T8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efhc1Q9D9T8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms