Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Actrt1Q9D9J3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Actrt1Q9D9J3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms