Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2e2Q9D902 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gtf2e2Q9D902 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms