Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnot8Q9D8X5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cnot8Q9D8X5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms