Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erp27Q9D8U3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erp27Q9D8U3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms