Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc91Q9D8L5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc91Q9D8L5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc91Q9D8L5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc91Q9D8L5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms