Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc52a2Q9D8F3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc52a2Q9D8F3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms