Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chmp4bQ9D8B3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chmp4bQ9D8B3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms