Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem54Q9D7S1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem54Q9D7S1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms