Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lpcat2bQ9D5U0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lpcat2bQ9D5U0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms