Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930513O06RikQ9D549 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms