Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Phf6Q9D4J7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Phf6Q9D4J7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms