Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Efhd1Q9D4J1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Efhd1Q9D4J1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Efhd1Q9D4J1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Efhd1Q9D4J1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Efhd1Q9D4J1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Efhd1Q9D4J1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms