Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syce1Q9D495 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms