Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpn3Q9D3W4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpn3Q9D3W4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms