Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Katnal2Q9D3R6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms