Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pramef12Q9D2F1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramef12Q9D2F1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms